在行政许可的监督检查方面，实践中存在的主要问题有两个方面：一是行政机关重许可，轻监督检查，一些行政机关甚至只许可，不监管。使得行政机关对于行政许可，只有实施许可的权力，却不承担监督检查的责任，实际使行政许可失去了本来意义，直接导致了各种违法现象的发生，引起了市场的混乱。二是行政机关对行政许可的监督检查没有纳入制度化轨道。一些行政机关要么不监督检查，要么就不分情况地搞突击检查、运动检查、重复检查，检查的程序和手段都很不规范，执法扰民的现象比较严重。一些行政机关在监督检查活动中存在吃、拿、卡、要以及乱收费、乱摊派、乱罚款的现象，引起被许可人的不满。一些行政机关及其工作人员在监督检查中发现行政许可实施过程中的违法行为，以及被许可人违法从事行政许可事项活动的违法行为，不及时纠正，甚至滥用职权、徇私舞弊，严重影响了行政机关的正常管理活动，影响了经济、社会生活的稳定，影响了市场经济的健康发展。总之，对行政许可的监督检查没有制度约束，使得一些行政机关的各种检查随意性很大，程序比较乱，效果并不好，甚至滋生了腐败现象。
针对行政许可监督检查中存在的上述问题，本章规定了以下几个方面的具体制度和措施：一是规定了上级行政机关对下级行政机关实施行政许可的监督检查制度；二是规定了行政机关自身建立健全书面检查为主的制度、检查记录归档的制度、通过互联网实施监督检查的制度以及检查结果公开的制度；三是规定了行政机关对被许可人的生产经营等活动实施抽样检查、实地检查的制度；四是规定行政机关监督检查活动中的廉洁制度；五是规定了行政机关之间在监督检查活动中的抄告制度；六是规定了行政机关在监督检查活动中发现各种违法行为的处理制度；等等。本章的这些规定对保障行政机关严格依照法定程序，认真负责地实施监督检查，具有重要意义。
第六十条 上级行政机关应当加强对下级行政机关实施行政许可的监督检查，及时纠正行政许可实施中的违法行为。
【释义】本条是关于上级行政机关对下级行政机关实施行政许可进行监督检查的规定。
一、上级行政机关实施监督检查的必要性
行政许可是行政机关依法对社会、经济事务实行事前监督管理的一种重要手段，也是行政机关日常行政管理活动中的重要内容。行政机关能否依法实施行政许可，与人民群众的利益密切相关，也直接影到政府的形象，关系到能否建立一个廉洁、高效和法治的政府。长时期以来，行政机关在实施行政许可中存在的一个主要问题，就是违法实施行政许可，搞暗箱操作，有些行政机关甚至把行政许可作为权力寻租的一种手段，人为地造成个人或者组织在行政许可中的不公平竞争。一些企业和个人为了取得行政许可，还要托关系、给好处，助长了行政许可中腐败现象的蔓延。在一定意义上，可以说行政许可已经成为一个腐败源。行政许可实施中之所以存在腐败现象，从内在原因上看，就是行政机关实施行政许可，只有权力，没有责任，行政许可在一些行政机关及其工作人员心里，只是权力许可，没有成为责任许可。从外在原因上看，就是缺乏一套对行政许可实施机关的健全、完善和有效监督机制。
对行政机关实施行政许可进行监督，主要有以下几种方式：一是权力机关实施监督。但是，权力机关对行政机关实施行政许可的行为不适宜进行经常性的、具体性的监督检查，否则就有干预行政权力的行使之嫌。二是人民法院的监督。但是，人民法院对行政机关实施行政许可的监督，也只能限于对具体诉讼案件的监督，而不适宜进行经常性的具体性的监督。三是平行的行政机关相互之间的监督，但平行的行政机关相互之间的监督，范围比较有限，约束力也不够强。四是群众和当事人的监督。但群众和当事人监督对行政机关的约束力也不够强。除了上述监督方式之外，还有一种重要的监督方式，即上级行政机关的监督。与其他几种监督方式相比，上级行政机关对下级行政机关实施行政许可的监督，是更重要、更日常、更具体和更实际有效的监督。上级行政机关监督检查的这一特点是由我国行政机关上下级之间的领导体制决定的，对此下一个问题将述及。
本法第十条规定：“县级以上人民政府应当建立健全对行政机关实施行政许可的监督制度，加强对行政机关实施行政许可的监督检查。”本条规定的目的，旨在进一步强调上级行政机关对下级行政机关实施行政许可行为的监督检查责任。
行政许可法草案在“监督检查”一章中最初只规定了行政机关应当依法对被许可人从事行政许可事项的活动进行监督检查，没有规定上级行政机关对下级行政机关的监督。在草案审议过程中，一些常委会组成人员提出，当前行政机关在实施行政许可的过程中存在两个主要问题，一个是只有权力没有责任，第二个是缺乏公开、系统和有效的监督机制，草案只着重规定行政机关对被许可人的监督检查，而对如何监督行政机关的实施许可行为规定得不够充分，不利于加强对行政机关的监督和约束，不利于解决当前行政许可实施中的一些突出问题。因此，立法机关在吸取各方面意见的基础上，在“监督检查”一章中专设一条，规定上级行政机关应当加强对下级行政机关实施行政许可的监督检查，及时纠正行政许可实施中的违法行为。
二、上级行政机关监督检查的法律依据
规定上级行政机关对下级行政机关实施行政许可的监督检查，这主要是由行政机关上下级之间的领导体制决定的。根据宪法和地方组织法的规定，我国行政机关上下级之间的领导体制主要有以下特点：地方各级人民政府对上一级国家行政机关负责并报告工作；全国地方各级人民政府都是国务院统一领导下的行政机关，都服从国务院；县级以上的地方各级人民政府领导所属各工作部门和下级人民政府的工作，有权改变或者撤销所属各工作部门的命令、指示和下级人民政府的不适当的决定、命令；人民政府的各工作部门受人民政府的统一领导，并依照法律或者行政法规的规定受上级人民政府主管部门的业务指导或者领导。人民政府上下级之间这样一个领导体制，就决定了上级行政机关有权对下级行政机关实施行政许可的行为进行监督和检查。
三、哪些上级行政机关可以成为监督检查主体
从监督检查的主体上说，上级行政机关对下级行政机关实施行政许可行为的监督检查，既包括各级人民政府对其所属各工作部门实施行政许可行为的监督检查，也包括上级人民政府对下级人民政府实施行政许可行为的监督检查，还包括上级人民政府的业务主管部门对下级人民政府相关部门实施行政许可行为的监督检查。
此外，对下级行政许可活动实施监督检查的上级行政机关有以下几种特殊情况：一是依据本法第二十三条的规定，法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织，在法定授权范围内以自己的名义实施行政许可。对这类公共组织实施行政许可的监督检查由其法定的上级行政机关负责。比如，依据证券法规定，国务院证券管理机构是具有管理公共事务职能的事业单位，在法律规定的范围内有权实施行政许可，对其进行监督检查的上级行政机关就是国务院。二是依据本法第二十四条的规定，行政机关依照法律、法规和规章的规定，可以委托其他行政机关实施行政许可，委托行政机关对受委托行政机关实施行政许可的行为应当负责监督检查，并对该行为的后果承担法律责任。三是依据本法第二十五条的规定，经国务院批准，省级人民政府根据精简、统一、效能的原则，可以决定一个行政机关行使有关行政机关的行政许可权。对于一个行政机关行使有关行政机关的行政许可权的情况，本级人民政府和上级人民政府都有权对该行使行政许可权的行政机关进行监督检查，上级人民政府对原来和现在具有业务主管或者指导关系的部门也有权进行监督检查。
四、监督检查的方式
上级行政机关对下级行政机关实施行政许可监督检查的方式可以灵活多样，不拘一格。既可以进行不定期的抽样检查、抽点检查、抽部门检查，也可以定期检查、定点检查或者定行业、定部门检查。既可以对下级行政机关实施行政许可的具体行为进行监督检查，比如，上级机关可以随时监督检查下级机关实施行政许可的具体过程，也可以对下级行政机关实施行政许可的总体情况进行监督检查，比如，上级机关可以要求下级机关对某一类行政许可的工作情况作书面汇报。
五、监督检查的范围
上级行政机关对下级行政机关实施行政许可的监督检查，主要是指对其实施行政许可行为合法性的监督检查，以保证下级行政机关依法许可、依法行政。对下级行政机关实施行政许可的合法性进行监督检查，主要包括以下两个方面的内容：
一方面，要监督检查实施行政许可的行政主体和权限是否合法。行政许可只能由具有行政许可权的行政机关在法定的范围内实施，法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织，在法定的权限范围内可以以自己的名义实施行政许可，行政机关在其法定职权范围内，依照法律、法规、规章的规定，可以委托其他行政机关实施行政许可。上级行政机关在监督检查下级行政机关实施行政许可行为时，一旦发现行政许可实施的主体和权限不合法，时予以纠正。比如，根据公民出入境管理法的规定，中国公民因私出境，只能由其户口所在地的公安机关实施行政许可；中国公民因公务出境，只能由外交部或者外交部授权的地方外事部门实施行政许可；海员因执行任务出境，只能由港务监督局或者由港务监督局授权的港务监督实施行政许可。对于因不同事由出境的公民依法实施行政许可的行政机关也不同，如果由公安部门实施中国公民因公务出境的行政许可，或者由外交部门实施海员执行任务出境的行政许可，都属于实施行政许可的主体和权限违法，上级行政机关在监督检查时应当予以纠正。
第二个重要内容是，要监督检查实施行政许可的程序是否合法。没有程序的正义就没有实体的正义。依照法定的程序实施行政许可，是保证行政许可公平、公正，保证申请人合法权益以及保证行政机关依法行政的重要条件。本法第四章根据不同情况，对行政许可实施的一般程序作出了详细规定，其他有关的法律、法规、规章对一些特定行政许可的程序作出了专门规定，这些规定都是行政机关实施行政许可的依据。上级行政机关对下级行政机关实施行政许可的监督检查，一个很重要的内容，就是监督检查下级行政机关在实施行政许可时，是否严格以本法律以及其他有关的法律、法规、规章为依据，特别是要监督检查下级行政机关在实施行政许可过程中，是否认真落实了那些法定的具有关键意义的程序。比如，要根据本法第四章的规定，监督检查下级行政机关是否将有关行政许可的事项、依据、条件、数量、程序、期限以及需要提交的全部材料的目录等在办公场所公示；要监督检查下级行政机关在实施自然资源的开发利用和公共资源的配置以及直接关系公共利益的特定行业的市场准入等事项的行政许可时，是否依法通过招标、拍卖等公平竞争的方式作出决定；要监督检查下级行政机关在实施直接关系申请人和利害关系人之间重大利益的行政许可时，是否严格依法告知了有关当事人具有申请听证的权利，并依照法定程序进行了听证；要监督检查下级行政机关是否在法定的期限内实施了行政许可；要监督检查下级行政机关在作出行政许可决定后，是否将行政许可决定和申请人的有关资料予以公开，允许公众查阅；等。如果发现下级行政机关在实施行政许可的程序中有违法行为，上级行政机关应当及时采取措施予以纠正。
当前，行政机关在实施行政许可的具体程序中，有两个问题比较严重，一是与被许可人私下接触，甚至向被许可人“吃、拿、卡、要”，通过行政许可实行权力寻租；二是在实施行政许可时乱收费、高收费，甚至没有收费就疏于许可、疏于管理。这两种现象大量滋生了腐败现象，损害人民群众的利益，损害了行政机关的形象。为此，本法第二十七条专门规定：“行政机关实施行政许可，不得向申请人提出购买指定商品、接受有偿服务等不正当要求。”第五章专门规定，行政机关实施行政许可和对行政许可事项进行监督检查，不收取任何费用；行政机关提供行政许可申请书格式文本，不收取费用；行政机关实施行政许可，应当依照法定的项目和标准收费，所收取的费用必须全部上缴国库，任何机关或者个人不得以任何形式截留、挪用、私分或者变相私分。因此，上级行政机关在监督检查下级行政机关实施行政许可时，应当将这两个问题作为十分重要的内容予以监督检查，一旦发现有关行政机关及其工作人员的违法现象，要坚决及时地纠正，对行政许可实施中的犯罪行为，要依法移交司法机关追究其刑事责任。
根据本条的规定，各上级行政机关。包括国务院及其部门、县级以上地方各级人民政府及其部门都应当建立健全各项监督制度，加强对下级行政机关实施行政许可的监督检查，及时纠正行政许可实施过程中的违法行为。实践中，一些地方积累了不少成功的经验和做法。比如，有的地方建立起谁审批、谁负责的制度，将责任落实到部门和行政机关的个人。有的地方建立健全社会监督制度、行政机关内部监察制度以及对行政许可的事后跟踪监管制度，从各个方面加强对下级行政机关实施行政许可的监督。
第六十一条 行政机关应当建立健全监督制度，通过核查反映被许可人从事行政许可事项活动情况的有关材料，履行监督责任。
行政机关依法对被许可人从事行政许可事项的活动进行监督检查时．应当将监督检查的情况和处理结果予以记录，由监督检查人员签字后归档。公众有权查阅行政机关监督检查记录。
行政机关应当创造条件．实现与被许可人、其他有关行政机关的计算机档案系统互联，核查被许可人从事行政许可事项活动情况。
【释义】本条是失于行政机关建立健全监督制度，履行对被许可人监督责任的规定。
一、对被许可人活动从事监督检查的意义
根据本法第十条的规定，行政机关对个人或者组织从事行政许可事项的活动应当实施有效监督，即行政机关实施行政许可应当遵循责任原则，实行责任许可，不仅重视事前许可权力的行使，更要承担起许可后对被许可人从事许可事项活动的监督责任。本条规定就是总则第十条有关许可责任原则的进一步具体化。
行政许可实践中存在的一个重要问题是，重事前许可、轻事后监管，或者只许可、不监管的现象比较普遍。重事前许可、轻事后监管或者只许可、不监管，使行政许可失去了应有意义，增加了市场的混乱和无序，甚至助长了各种违法犯罪现象的产生，因为被许可人就特定的事项取得许可后，在市场活动中如果失去行政机关的必要监督和管理，其追求和选择自身利益的行为就极有可能向任性、无序的方向发展，进而不可避免地与社会的整体利益或者公共利益发生冲突。比如，被许可人在取得经营餐饮业的经营许可证后，如果没有食品卫生部门事后经常性的检查、监督和管理，就很难保证其生产经营的食品符合行政机关实施许可时所要求的卫生标准。所以，行政机关对被许可人的事后监督管理，与事前的实施行政许可具有同等的重要性。在一定意义上甚至可以说，监督比许可更重要，行政机关只有依法加强对被许可人从事行政许可事项活动的监督管理，才能保证被许可人的生产经营等活动切实在行政许可的范围内进行。
二、建立健全对被许可人的监督检查制度
行政机关应当建立健全对被许可人的监督管理制度，将对被许可人从事行政许可事项活动的监督管理制度化、规范化。这个监督管理制度应当包括以下几方面的基本内容：一是要明确行政机关对被许可人的监督管理义务，不承担监督管理义务，就不能行使行政许可权力。二是要明确行政机关对被许可人的各项具体监督管理职责，特别是要明确行政机关对被许可人是否真正享有应予许可的相关权利、是否在行政许可所确定的范围内活动等事项，进行监督管理的具体方式和程序，明确对于被许可人有伪造材料骗取许可、超越许可范围活动、拒不接受行政机关监管等行为的，行政机关可以依法采取的各种措施。三是要明确行政机关中实施行政许可的具体部门和工作人员的责任，特别是要明确不履行监督管理义务、监督管理不力、对被许可人的违法行为不予查处的部门和工作人员的具体责任。
三、建立以书面检查为主的制度
根据本条的规定，行政机关在建立健全监督制度后，主要应当通过核查反映被许可人从事行政许可事项活动情况的有关书面材料，对被许可人履行各项监督管理责任。实践中，一些行政机关对被许可人的生产经营等活动要么疏于监督检查，要么频繁地实地检查，干扰和妨碍被许可人正常的生产经营活动。实际上，行政机关对多数行政许可的事项都是可以通过核查被许可人的有关书面材料来判断其是否依法从事有关活动的。比如，某药品生产企业取得药品生产许可证后所生产的药品是否符合许可证所要求的质量标准，行政机关就完全可以通过该企业提供的相关生产情况的书面材料以及有关专业技术组织的检验报告予以认定。所以，被许可人从事行政许可事项的相关材料是行政机关对其实施监督管理的基础。根据本条的规定，行政机关对被许可人的生产经营等活动，除非必须通过实地检查的以外，原则上应当都通过书面核查的方式进行监督检查。这个规定的基本初衷是，减少行政执行成本，提高行政管理效率，避免行政机关执法扰民。
四、建立监督检查的记录归档制度
根据本条第二款的规定，行政机关依法对被许可人从事行政许可事项的活动进行监督检查时，应当将监督检查的情况和处理结果予以记录，由监督检查人员签字后归档。作出这一规定有以下几方面的作用：一是做好对被许可人从事许可事项活动进行个别检查监督、具体检查监督的情况记录和归档工作，是将行政许可的事后监督系统化和制度化的重要条件，可以为行政机关全面监督检查被许可人的活动、正确评估该项行政许可的价值提供重要依据。二是有利于加强行政机关及其工作人员进行自我监督，提高其工作的责任心，保证依法行政，因为行政机关对被许可人的监督检查是否勤勉，对被许可人的处理是否合法，在档案上都得到反映。三是有利于增强被许可人的法律意识和道德意识，促使其自觉地依法开展生产经营等活动，因为将对被许可人从事行政许可事项的监督检查情况记录归档，实际上就建立起了被许可人的信用档案。为此，有关行政机关在依法对被许可人从事行政许可事项的活动进行具体的监督检查时，应当将监督检查的情况和处理结果予以认真记录，由监督检查人员签字后归入档案，以保证监督检查情况的真实性和规范性。
五、建立互联网监督检查制度和公众查阅监督检查记录制度
此外，为提高行政机关监督检查的效率和增加监督检查的透明度，本条还规定了以下两项具体制度：一是通过互联网监督检查制度。为充分利用信息化时代高新技术带来的成果，实行信息共享，推行电子政务，本条还规定，行政机关应当创造条件，实现与被许可人、其他有关行政机关的计算机档案系统互联，以便核查被许可人从事行政许可活动的各种情况，提高工作效率。这样，一些被许可人需要向行政机关报送的材料，就可以通过网络或者电文报送，方便了被许可人，也实现了行政机关之间的资料共享。二是公众查阅行政机关监督检查记录制度。行政机关对被许可人的监督管理情况也应当是公开的，只有公开的监督管理才能实现公平、公正的监督管理、认真负责的监督管理。因此，本条专门规定，公众有权查阅行政机关的监督检查记录。公众监督是督促和保证行政机关依法行政的重要力量。公众有权查阅行政机关的监督检查记录，可以有效地监督行政机关对所有被许可人从事行政许可事项的活动，都切实依法进行监督检查，用同样的标准公平、公正地进行监督检查，从而防止监督检查中的各种违法现象。但是，根据本法第五条的规定，公众查阅行政机关的监督检查记录，也有例外情形，即涉及国家秘密、商业秘密或者个人隐私的有关记录，公众不得查阅。